福州市采用多种形式推进环保基础设施建设。已投入运行的污水处理厂有祥坂厂、洋里厂、金山厂、马尾青洲厂和快安厂；已建成了6座县级污水处理厂，具备污水处理能力15万吨。明年底前，福州市还将新建成7座污水处理厂，分别为位于市区的连坂污水处理厂、浮村污水处理厂、马尾长安污水处理厂，位于闽侯城关、福清、闽清、永泰等地的4座污水处理厂。目前市区日污水处理能力46万吨，城市生活污水处理率由2004年的65％提高到目前的80.21%。
根据规划，福州还将用3至5年，在红庙岭建立我省第一个废物综合处置环保生态园区。建成全国性垃圾处置科研基地和生态环保工作示范基地。总投资近4亿元的红庙岭垃圾焚烧发电厂及沼气发电项目已分别于2007年7月、12月投入运行。垃圾焚烧发电厂日处理生活垃圾1200吨，年发电量约1亿千瓦时。填埋气发电厂年发电量可达1200万千瓦时，每年可减排二氧化碳12万吨、二氧化硫3万吨。
据悉，福州第二期垃圾焚烧发电厂选址拟定闽侯青口原垃圾填埋场附近，拟建规模为日处理垃圾600吨，主要承接闽侯、青口汽车城等周边城区居民的生活垃圾。第二期垃圾焚烧发电厂建成后，福州市日均垃圾处理量可达2600吨。
“十一五”期间福州将实现所有县（市）均建成一座垃圾无害化处理厂。同时结合开展农村“家园清洁行动”，在乡镇一级推广垃圾处理产业化运作。